定向鉆穿越技術在管道工程中具有許多優勢，但也存在一些局限性，主要包括以下幾個方面：

地質條件的限制：定向鉆穿越技術對于地質條件的要求較高，特別是在遇到堅硬或極易坍塌的地層（如花崗巖、卵礫石、流沙等）時，需要詳細勘察并謹慎選擇鉆機和鉆具。在這些地層中，導向鉆頭容易偏離設計方向，擴孔難度增大，可能導致施工效率低下甚至工程失敗。

技術標準的缺乏：目前，我國尚未統一定向鉆穿越技術的技術標準和施工驗收規范。這導致對工程設計、施工質量的把控缺乏官方依據，一旦發生質量事故，對責任方的認定也造成一定難度。

空隙處理難題：在擴孔拖拉施工結束時，管材與回擴孔之間的空隙不能像開槽敷設施工那樣進行回填夯實。這對于對管材沉降要求較高的工程來說，存在一定的風險。

環保風險：在某些地層中（如卵礫石地層），由于地層透水性較強，易出現泥漿冒泡現象，存在較大的環境保護風險。如出現泥漿嚴重流失的情況，必須重復進行洗孔作業，不僅效率低下，而且會造成施工成本的增加。

施工難度大：定向鉆穿越技術需要通過鉆頭對地下巖土進行穿透，這就要求施工人員對地下巖土的情況進行準確判斷。然而，由于地下巖土常常存在復雜的地質情況（如水文地質變化、土層結構變化等），施工難度較大。

施工效率低：由于定向鉆穿越技術的施工難度較大，施工速度相對較慢，需要占用大量的施工時間和人力資源。為了提高施工效率，可以采用多管并置的方式或配合合適的土方處理方法。

綜上所述，雖然定向鉆穿越技術在管道工程中具有許多優勢，但也存在一些局限性。在實際應用中，需要根據具體工程情況和地質條件進行綜合考慮，選擇合適的施工方法和技術措施。